1937年，日本军队进入沦陷的南京城，奉命掩埋中国死难士兵和战俘尸体。与此同时，市中心的圣马德伦教堂中迎来了一群不速之客，十来个女学生和秦淮河女子，她们殊途同归只为同一件事――逃难。紧接着，许多男人也因为各种原因进入了教堂。围墙外的日军寻找各种借口进入教堂，圣马德伦教堂的后院成为他们填埋尸体掩盖罪证的目标，国际安全区的组织者尝试各种解救教堂被困人员的方案，却屡屡失败。教堂中的男人们为了保护藏在教堂阁楼和地窖中的女人，献出了自己的生命，女人们或者选择了有尊严地死去，或者进行了最壮烈的抵抗。在这四十九个日夜里

1937年，日本军队进入沦陷的南京城，奉命掩埋中国死难士兵和战俘尸体。与此同时，市中心的圣马德伦教堂中迎来了一群不速之客，十来个女学生和秦淮河女子，她们殊途同归只为同一件事――逃难。紧接着，许多男人也因为各种原因进入了教堂。围墙外的日军寻找各种借口进入教堂，圣马德伦教堂的后院成为他们填埋尸体掩盖罪证的目标，国际安全区的组织者尝试各种解救教堂被困人员的方案，却屡屡失败。教堂中的男人们为了保护藏在教堂阁楼和地窖中的女人，献出了自己的生命，女人们或者选择了有尊严地死去，或者进行了最壮烈的抵抗。在这四十九个日夜里

因丈夫在外和情人有了孩子，婚后多年未能生育的百合子（永作博美 饰）在提交了离婚申请书后，只身落寞返回故乡。此前不久，她的继母乙美刚刚过世，失去妻子周到照顾的老父亲热田良平（石桥莲司 饰）凄凉内疚。乙美生前曾照顾许多内心有各种障碍的孩子，绰号小芋的女孩井本幸惠（二阶堂富美 饰）正是其中一员。她此前受乙美所托，开心满怀地来到热田家，找到乙美生前制作的漫画笔记，要给逝者办一场热热闹闹的七七聚会。小芋和巴西人后代春乃助（冈田将生 饰）相继到来，令这对沉浸在悲伤气氛中的父女慢慢振作起来。他们回忆着乙美生前的点点滴滴