故事的主角是一个北海道的学生修次。他的同班同学千濑在故事开始的时候就已向修次表白了。但因为千濑的害羞性格和修次的不善辞令，所以他们就以写交换日记来开始他们的情侣关系。一日，当修次和朋友到札幌购物的时候，不明来历的轰炸机对札幌进行了猛烈的轰炸。修次和他的朋友找地方作掩护时，他见到了一个快速的小型飞行物体向敌军的轰炸机进行攻击。修次和他的朋友失散了之后，他在废墟堆中徘徊。当他在废墟堆当中见到了增生了翅膀、武器、不再心跳且衣着破烂的千濑之后，千濑告诉了他，她已经成为了日本自卫队的“最终兵器”，故事于是开始……

突如其来的一场轰炸袭击夺走了艾比老公与孩子的生命，让艾比深陷痛苦之中。作为CIA的她决心揪出幕后真凶，势必将其绳之以法。在艾比强烈要求下，上级将她派到一处CIA特殊地堡基地去调查此次袭击事件。随着深入调查，艾比锁定了嫌疑人哈切特并发现轰炸事件可能是由无人机所执行的，并向上级上报了此消息。CIA派某三角洲部队对哈切特进行秘密逮捕行动，并押送他进入地堡。进入地堡之后，随行人员要求对哈切特进行审讯，然而在内应帮助下，他反杀审讯人员然后在基地进行了一场疯狂虐杀……身边的战友一个个倒下，艾比唯有独自战斗才能获得一线

空军飞行部队模拟舱内，刘禅与赵宇航作为本届学员中的佼佼者，展开了部队模拟战“第一机长”之争，却不料两人因战术分歧造成失误并得到回炉重造的惩罚：在限期内，两人必须带出两支能打胜仗的全新队伍，否则他们将面临被开除的危险。可是，这届队伍也太难带了，更难的是，还要挑战女中豪杰学院第一女机械师——桃夭夭!

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